Kolonoskopi hem tanısal hem de terapötik olarak kullanılan ve genellikle sedasyon (anestezi) altında yapılan bir işlemdir. İşlem kolonoskop adı verilen fiberoptik bir kamera ve monitör yardımı ile makattan girilerek rektum, kolon ve terminal ileumun bir bölümünün incelenmesine izin veren bir işlemdir. Kolonoskopi işleminden bir gün önce hastaya müshil ilacı verilerek bağırsak temizliği yapılır. Kullanım alanlarının başında alt gastrointestinal sistem kanamaları, açıklanamayan demir eksikliği anemisi, enflamatuar barsak hastalığı, kolon polipleri, kolon ve rektum kanseri hatalıklarında yaygın olarak kullanılmaktadır.